В начале 1990-х обстановка в стране значительно изменилась, что очень сильно коснулось ВМФ.
Из восьми кораблей измерительного комплекса было продано на металлом семь кораблей. Причём КИК «Маршал Неделин» не прослужил при этом и десяти лет. После пяти лет эксплуатации он был поставлен в ремонт и фактически был разграблен. КИК «Сахалин» ныне принадлежит КНР. Третий корабль проекта 1914, «Маршал Бирюзов», был разрезан на стапеле.
По состоянию на 2011 год, в России осталось два корабля, способных работать с космическими объектами:
«Маршал Крылов» занимался контролем параметров боевых блоков при пуске на предельную дальность в 2004 и в 2011 году (МБР «
Тополь» и «
Булава»).
27 августа 2011 года с борта атомной подводной лодки
«Юрий Долгорукий» был осуществлён шестнадцатый испытательный пуск межконтинентальной баллистической ракеты
«Булава», осуществлённый на максимальную дальность полёта по прицельной точке в акватории Тихого океана. Контроль за прибытием боевых блоков в заданную точку осуществлял КИК «Маршал Крылов».